一、粉碎方式的不同
流化床气流粉碎机是物料在高压气流的带动下在4个或3个喷嘴连线交汇处通过物料自身碰撞而实现粉碎，因不与其它物料碰撞，故不存在物料污染等现象。同时对于硬度偏高的物料同样粉碎效果较好，不影响设备寿命。
圆盘式气流粉碎机是物料通过气流直接撞击在为粉碎室的内壁上，碰撞实现粉碎，故此粉碎过程对于粉碎腔体内壁的内衬存在磨损现象，物料存在被污染的可能，同时内衬需要定期更换，备件费用较高。
二、碰嘴布置的方式不同
流化床气流粉碎机的喷嘴垂直于粉碎腔体，而圆盘式气流粉碎机粉碎喷嘴切线于粉碎室。
三、控制粒度的方式不同
流化床气流粉碎机通过调节分级轮高速旋转速度控制粒度，粒度精度控制较好；而圆盘式气流粉碎机仅通过调节加料速度来调节，粒径不易控制。
四、系统风压不同
流化床气流粉碎机整个粉碎过程为负压过程，系统后面的引风机需要高压型，整 个粉碎过程无粉尘泄露，不污染生产环境。而圆盘式气流粉碎机为正压型，对引风机要求不高，甚至可以不用引风机和除尘器，粉碎过程易造成粉尘泄露，生产环境极易被污染。
五、控制柜做法不同，成本不同
因流化床气流粉碎机通过调节分级轮高速旋转控制粒度，所以其需要变频器来控制，所以成本相对很高。而圆盘式气流粉碎机，对控制要求不高，只是对系统中其他如卸料阀或除尘器控制，相对成本也很低。
六、成品粒度分布状态不同
相对于扁平式气流粉碎机而言，流化床式气流粉碎机的粉碎粒径分布范围更窄，粒径的均匀性更好。
